2005年吞吐量为2,718,470TEU, 比上年增长13%, 世界排名第三十位。
　　巴拿马运河的扩建计划对巴拿马港口乃至美国东海岸和加勒比海地区的港口都将产生深远的影响。
　　巴拿马主要港口密切关注着超巴拿马型船舶能力的最新变化，正在为迎接超巴拿马型船的到来作准。预计下一个10，巴拿马年运河的中转货运量可达125万TEU。
　　新扩建的运河船闸长427米、宽54.86米、吃水深16.5米。巴拿马港口和美国东海岸港口的大批运营商将由此获益。
　　投资约52.5亿美元的运河扩建工程完工后，预计每年可给巴拿马运河及相关产业带来的额外收入高达11亿美元。
　　巴拿马运河管理局预测，到2020年每天将出现大批1.25万TEU的超巴拿马型“巨无霸”集装箱船，每天通过运河船舶将增加10到11艘，年增长量可达3,500船次。
　　很明显，巴拿马运河正面临着大型集装箱船的挑战，这些船主要来自南美、美国中部、加勒比海地区，以及从亚洲来到美国东海岸。
　　巴拿马运河管理局估计，到2025年亚洲和美国东海岸之间的进出口贸易总额，将从目前占全美贸易额的38%增加到49％。同时，美国东海岸的港口吞吐量将增加13%。
　　为了迎接“超巴拿马型”时代的来临，巴拿马各集装箱码头都严阵以待。南美最大集装箱码头Manzanillo已于2006年1月配置了3台22排超巴拿马型桥吊；Evergreen’s Colon 集装箱码头在其二期扩建中配备了1台19排桥吊；香港和记黄埔码头投资近10亿美元用于扩建巴尔博亚和克里斯托巴尔港口，已有6台超巴拿马型桥吊投入使用。目前，巴尔博亚和克里斯托巴尔两港口的吞吐量为200万TEU。以上三个集装箱码头集团还计划再投资15亿美元用于巴拿马港口的扩建，另加10亿美元用于在太平洋海岸新建一个中转码头。
　　巴拿马位于美洲的中部，东西两侧分别连接大西洋的加勒比海和太平洋，南北陆地分别与哥伦比亚和哥斯达黎加接壤。巴拿马国土面积不大，只有 78,200 平方公里，人口 280 万人，在美洲地区属于小国。但是，由于拥有连接太平洋和大西洋的著名巴拿马运河，而闻名天下。
　　巴拿马在加勒比海一侧有曼萨尼约港 (Manzanillo) ，离运河太平洋出口处不远有克利斯托瓦尔 (Cristobal) 、巴尔博亚等港口，这些港口基本上都是为通过巴拿马运河、来往于亚洲远东地区的集装箱船舶提供集装箱转运服务。因为现在的集装箱船越造越大，有些满载的集装箱船由于吃水超过了巴拿马运河 39.5 英尺的水尺限度 , 就无法通过巴拿马运河。于是，远洋承运人就决定在加勒比海一侧的曼萨尼约港，或在太平洋一侧的克利斯托瓦尔和巴尔博亚港，把一部分集装箱先从船上卸下来 , 通过巴拿马运河区的火车运送到运河的另一端 , 然后再重新装上已通过巴拿马运河的集装箱船舶。
　　曼萨尼约港 (Manzanillo) 的年吞吐量到 2001 年就一跃上升到了 100 万标准箱。在短短几年中，集装箱吞吐量有如此大幅度的增长 , 不外乎以下几个原因 :
　　一是 , 巴拿马运河是一条联通太平洋和大西洋的重要国际水道。仅仅 2000 年，通过巴拿马运河的商船总数就超过 13,600 艘次，货运量超过 1.94 亿吨，占全世界海运贸易量的 4 ％。虽然粮食、化肥、煤、焦碳等运量有所下跌，但集装箱船通过巴拿马运河的数量，从 1996 年以来每年都有增加。
　　二是 , 由于亚洲、特别是中国经济的发展势头强劲 , 来自东南亚和远东的国际集装箱货运量，在过去几年中出现了持续增长的势头。
　　三是 , 巴拿马运河当局正在研究实施运河扩建工程，以便吸引更多的船舶通过巴拿马运河。目前，能够通过巴拿马运河船型的最大限度是宽 106 英尺，长 965 英尺，吃水 39.5 英尺。巴拿马运河当局希望扩建工程在 2010 年全面完工后，通过巴拿马运河船型的最大限度，可以扩大到宽 180 英尺，长 1,265 英尺，吃水 50 英尺。
　　在加勒比海一侧的曼萨尼约港，吞吐的集装箱总量中，有 30 % 均出入于科隆 ( 巴拿马科隆省首府 ) 自由贸易区。科隆自由贸易区配送进出的集装箱货物一直以电子产品为主 , 而汽车备件和整车汽车的配送量也在不断上升。
　　公司总部设立在香港的和记港口投资集团，在离巴拿马运河太平洋出口处不远的克利斯托瓦尔和巴尔博亚两个港口，正在投资建设国际集装箱转运码头。